Самый понятный вид обрезки, при котором удаляются засохшие, заболевшие и сломанные ветки. При проведении санитарной обрезки требуется дезинфицировать инструменты при переходе на здоровые части, либо к другим деревьям. Отрезанные части дерева желательно в ближайшее время сжечь, иначе зараженные ветки станут рассадником грибковых спор и бактерий.
Если болезнь проявилась на стволе, но при этом не опоясывает его целиком по кругу, я стараюсь спасти яблоню. Пораженные ткани на стволе удаляю, срезая все до здоровой древесины, захватывая около 2-х см живой ткани яблони. Срез обмазываю на 3 раза (каждый раз после высыхания предыдущего слоя) раствором медного купороса. Старую листвы под деревом удаляю и сжигаю, как потенциальный источник нового заражения. В течение лета заболевшее дерево осматривается раз в неделю. При появлении болезни на листьях или плодах они удаляются, а все дерево опрыскивается раствором медного купороса